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Text File  |  1996-03-18  |  4KB  |  118 lines
  1. Applies changes to the Image window. If you don't like the effect you can Cancel it.
  2.  
  3. The effect of this button can be Canceled. Try it.
  4.  
  5. The name of selected residues will be marked in the Image window.
  6. Ctrl-Click on an atom to select the corresponding residue.
  7.  
  8. The name of selected residues will not be marked in the Image window.
  9. Ctrl-Click on an atom to select the corresponding residue.
  10.  
  11. Selected residues will be painted.
  12. The way selected residues are painted is set in the Image/'Pen Settings...' dialog.
  13. Ctrl-Click on an atom to select the corresponding residue.
  14.  
  15. Selected residues will not be painted.
  16. The way selected residues are painted is set in the Image/'Pen Settings...' dialog.
  17. Ctrl-Click on an atom to select the corresponding residue.
  18.  
  19. Side chains will be shown on selected residues.
  20. Ctrl-Click on an atom to select the corresponding residue.
  21.  
  22. Side chains will not be shown on selected residues.
  23. Ctrl-Click on an atom to select the corresponding residue.
  24.  
  25. Not available now because the display mode 'Main Chain Only' is NOT checked.
  26.  
  27. Side chains will not be shown on selected residues.
  28. Ctrl-Click on an atom to select the corresponding residue.
  29.  
  30. Temperature factors will be shown.
  31.  
  32. Temperature factors will be hidden.
  33.  
  34. Structure electron density will  be shown.
  35.  
  36. Structure hydrogen atoms will  be hidden.
  37.  
  38. Structure electron density will  be shown.
  39.  
  40. Structure electron density will  be hidden.
  41.  
  42. Structure water will be shown.
  43.  
  44. Structure water will be hidden.
  45.  
  46. Structure hetero-atoms will be shown.
  47.  
  48. Structure hetero-atoms will be hidden.
  49.  
  50. Structure bases will be shown.
  51.  
  52. Structure bases will be hidden.
  53.  
  54. Structure residues will be shown.
  55.  
  56. Structure residues will be hidden.
  57.  
  58. The ionic bonds will be shown.
  59.  
  60. Will show the ionic bonds. A dialog prompts to look for them if they have not yet been looked for. Cmd-I is the keyboard shortcut.
  61.  
  62. Not available now because ionic bonds have not been looked for yet.
  63.  
  64. Will show the ionic bonds. A dialog prompts to look for them if they have not yet been looked for. Cmd-I is the keyboard shortcut.
  65.  
  66. If display mode is 'Main Chain Only', H-bonded side chains will be drawn.
  67.  
  68. If checked and if display mode is 'Main Chain Only', H-bonded side chains will be drawn.
  69.  
  70. Not available now because the display mode 'Main Chain Only' has not been checked or because hydrogen bonds have not been looked for yet.
  71.  
  72. If checked and if display mode is 'Main Chain Only', H-bonded side chains will be drawn.
  73.  
  74. Hydrogen atoms are visible. Check this item to hide them. Cmd-H is the keyboard shortcut.
  75.  
  76. Hydrogen bonds are not visible. Check this item to make them visible. Cmd-H is the keyboard shortcut.
  77.  
  78. Not available now because the display mode 'Alpha Carbon Only' is checked or because hydrogen bonds have not been looked for yet.
  79.  
  80. Hydrogen bonds are not visible. Check this item to make them visible. Cmd-H is the keyboard shortcut.
  81.  
  82. All atoms (main chain and side chains) will be shown.
  83.  
  84. Check to display all atoms (main chain and side chains).
  85.  
  86. Only the main chain atoms will be shown.
  87.  
  88. Check to display only the main chain atoms.
  89.  
  90. Only alpha carbons will be shown.
  91.  
  92. Check to display only the alpha carbons.
  93.  
  94. Used to display stereo structure images. This value can be changed dynamically with Cmd-‚Äî> & Cmd-<‚Äî when the front window is the stereo image.
  95.  
  96. The higher this value, the bigger  the motion increments; 5 seems to be a good value.
  97.  
  98. Checked because structure rotation will occur around this axis.
  99.  
  100. Select this rotation axis.
  101.  
  102. Checked because structure rotation will occur around this axis.
  103.  
  104. Select this rotation axis.
  105.  
  106. Checked because structure rotation will occur around this axis.
  107.  
  108. Select this rotation axis.
  109.  
  110. Not available in the present release.
  111.  
  112. Not available in the present release.
  113.  
  114. Not available in the present release.
  115.  
  116. In the present release, this is the sole display outlook which can be selected.
  117.  
  118.